Naruto: Gekitou Ninja Taisen! 3

Naruto: Gekitou Ninja Taisen! 3 ist der dritte Teil dieser Serie. Das Spiel wurde am 3. August 2004 angekündigt und am 20. November 2004 in Japan veröffentlicht. Das Spiel deckt die Ereignisse des Anime ab, von den Chunin-Prüfungen bis zum Bogen "Die Suche nach Tsunade". In diesem Teil wird die Fähigkeit eingeführt, während des Kampfes die Form zu wechseln, und einige Charaktere erhalten einen zweiten Spezialangriff. Außerdem erweitert das Spiel den Tag-Team-Modus aus Clash of Ninja 2 und gibt dem Spieler die Möglichkeit, Team-Specials einzusetzen. Während das Spiel ausschließlich in Japan veröffentlicht wurde, gab es später eine verbesserte Portierung unter dem Namen Naruto: Clash of Ninja Revolution mit weniger Charakteren.